La modalità di scrittura disc-at-once (disco in un colpo solo) scrive l'intero cd in un solo colpo, eventualmente scrivendo più tracce. L'intera incisione deve essere completata senza interruzioni e non possono essere aggiunte ulteriori informazioni. Ha il vantaggio per i CD Audio che verranno scritti senza interruzioni di laser e quindi vengono evitati ogni tipo di rumori dovuti ai blocchi di run-in e run-out tra un brano e l'altro. A causa del fatto che il laser viene spento e riacceso per ogni traccia, il masterizzatore lascia un pò di blocchi tra le tracce, chiamati appunto blocchi di run-in e run-out. Se fatto correttamente, i blocchi devono essere silenziosi e normalmente non notabili. Altre volte, come già accennato, possono procurare fastidiosi colpi. Alcuni masterizzatori e/o software possono non permettere di controllare le dimensioni della pausa quando si registra in modalità track-at-once, lasciando 2 secondi di pausa anche se sul cd di origine non c'è. In questo caso consigliamo la scrittura disc-at-once che evita questi problemi. Attenzione: questa modalità occupa molto spazio su Hard Disk; assicurarsi quindi di avere almeno 700 Mb liberi.

La modalità di scrittura Track-at-once permette invece la scrittura in più riprese. La lunghezza minima di una traccia è 300 blocchi (600k per dati tipici di un cd), e un massimo di 99 tracce per disco, in più un piccolo spreco di spazio associato con il fermarsi e il ripartire del laser.

Alcuni masterizzatori, come il Philips CDD2000, permettono la registrazione session-at-once. Questo dà la possibilità di controllare la pausa tra le tracce e permette di scrivere più di una sessione; molto utile quando si incide un Cd extra.

In qualche caso può essere obbligatorio usare la registrazione disc-at-once. Ad esempio, potrebbe essere difficile o impossibile fare copie di backup di certi tipo di cd (come alcuni giochi protetti). Inoltre, alcune centrali di masterizzazione potrebbero non accettare dischi registrati in modalità track-at-once, perchè la pausa tra le tracce viene vista come errore.

La modalità raw

La modalità di scrittura RAW permette di eseguire copie di backup di software protetto.
Il software RAW (come Clone CD) e un CD recorder che supporti questa modalità permettono di eseguire copie identiche dei CD-Rom originali protetti conprensivi degli "errori voluti" dalle software house per impedire al loro duplicazione.
Il lettore di CD-Rom legge i dati dal supporto e, senza alcun controllo sulla correttezza o altra manipolazione, li invia al computer. In questo caso il computer riceve il blocco integrale dei dati (2.352 byte), comprese le informazioni per la rilevazione e correzione dell'errore (ECC).
Lo stesso processo avviene per le operazioni di scrittura: il computer invia al masterizzatore l'intero blocco dati, compresi i codici di rilevazione e correzione dell'errore.
La periferica non applica alcun controllo sulle informazioni ricevute e le trasferisce sul supporto CD-R direttamente.
Altresì, il comune software di masterizzazione corregge gli errori e crea una copia modificata corretta; appena si manderanno in esecuzione questi software, il programma andrà a ricercare in posizioni stabilite dal produttore questi "errori" e se non li trova rifiuta di funzionare.